A vírusok elleni legjobb védekezési módszer általában különböző biztonsági mechanizmusok használatán keresztül történik. Ez magába foglalja a tűzfalat, vírus szkennert vagy egyéb - a bejövő fájlok vírustartalmát vizsgáló eszközöket. A pendrive-oknál érdemes fontolóra venni a fájlok tartalmának használatba vétel előtti vírus szkennelést.
